Вторинну структуру має будь-який білок. Вона повністю визначається первинною (тобто амінокислотною послідовністю) та утворюється за рахунок численних водневих зв'язків.
Вторинна структура білка – це впорядкована будова поліпептидних ланцюгів, обумовлена водневими зв'язками між групами С=О та N-H різних амінокислот.
Вторинна структура білка – це спіраль з поліпіптиду. Підтримується така спіраль завдяки водневим зв'язкам між витками.
Амінокислотні залишки в білці пов'язані між собою пептидним зв'язком. Пептидна зв'язок має ряд особливостей, які значною мірою впливають на укладання поліпептидного ланцюга у просторі.