В принципі, мікрозелень зрізають ножицями, як тільки з'являться сім'ядольні листочки. Але можна дочекатися і появи 1 і навіть 2-го справжнього листочка, але не варто тягнути занадто довго, тому що найкорисніші рослини саме в стадії появи першого справжнього листочка.
На сьомий-десятий день після появи першої мікрозелені паростки досягають кількох сантиметрів у висоту, і їх уже можна зрізати для споживання. Але існують і такі мікрогрини, збирати врожай яких можна, можливо вже на п'ятий (зелена рукола) або шостий день (кольрабі).
Сходи зрізають відразу після появи перших двох листочків. Від проростків мікрозелень відрізняється способом вирощування. Проростки отримують з бобів і зерен і з'їдають цілком відразу після появи паростка. Мікрозелень вирощують із насіння і чекають, поки з'являться листи.
Як тільки молоді пагони досягнуть 10/15 см, їх можна вже зрізати і вживати у їжу.