При лікуванні хронічних хвороб кишечника пробіотик приймають до 4 разів на добу, сухі добавки – за годину до їди, рідкі – за 5-10 хвилин. Курс триває до 3 тижнів. При діареї пробіотик вживають до 6 разів на добу, курс триває до формування нормального випорожнення. У середньому, при неінфекційній діареї це до 5 днів.
У людей, які знають про користь пробіотиків для здоров'я, часто виникає питання, можна, можливо чи приймати пробіотики кожен день. І хоча з цього правила може бути кілька винятків, загалом відповідь є ствердною. Так, приймати пробіотики щодня – це безпечно та рекомендованим є саме такий прийом.
Пробіотики необхідно приймати не менше чотирьох тижнів. Їм потрібен час, щоб подіяти.
Тривалий прийом пробіотиків з високою концентрацією лактобактерій може призводити до пригнічення представників власної флори. Лактобактерії вчені називають природним антибіотиком. Вони мають здатність активно конкурувати з чужими бактеріями, виділяють речовини з антибіотикоподібною дією.