З квітня 1919 року командував 25-ою стрілецькою дивізією, що відзначилася у Бугурусланській, Білебеївській та Уфимській операціях під час контрнаступу Східного фронту проти військ Колчака. При взятті Уфи Чапаєв 8 червня 1919 був поранений, але залишився в строю.
Однак раніше Лев Троцький, якого деякі звинувачують у прагненні усунути з посади і навіть заарештувати Чапаєва, нагородив його після огляду частин дивізії у вересні золотим годинником і іменним револьвером. У листопаді 1918 р. Троцький підтримав клопотання Чапаєва про його направлення на навчання до Академії Генштабу.
на насправді, він був "Чепаєвим", і тільки так за життя і підписувався. Василь Іванович народився 9 лютого (28 січня за старим стилем) 1887 року в селі Будайка під Чебоксарами у багатодітній сім'ї потомственого тесляра та був за національністю мордвином.